Pył, kamień i inne zanieczyszczenia na powierzchni wymiany ciepła wymiennika rurowego zmniejszają jego sprawność. Wskutek zanieczyszczenia może pojawić się zmniejszony transfer energii, co prawdopodobnie zwiększy koszty produkcji. Małe wymienniki ciepła mają przeważnie niską przewodność cieplną. Pewna wymiana ciepła może nadal występować, mimo iż poszczególne rury przestają działać. W takich wypadkach najlepszym rozwiązaniem jest wykonanie odkamienianie wymiennika ciepła kraków. Tym działaniem zajmują się profesjonalne firmy, jakie na rynku są od dłuższego czasu.

Czyszczenie rurki wymiennika pod wysokim ciśnieniem — popularne również jako czyszczenie hydrodynamiczne — wykorzystuje strumień wody pod bardzo wysokim ciśnieniem. Metoda ta wykorzystuje specjalne dysze do skupienia strumienia wody wewnątrz rury wymiennika. Czyszczenie wymiennika ciepła kraków może być również prowadzona z wykorzystaniem specjalnych płynów chemicznych, jakie mają za zadanie oczyścić rury z kamienia, szlamu i innych zanieczyszczeń. Profesjonalne firmy używają specjalistycznych preparatów od renomowanych producentów. Jeżeli chcemy zrobić taką usługę, warto zgłosić się do firmy, która na rynku jest od dłuższego czasu i może pochwalić się renomą.